此书在理论部分将尽力系统阐述藏医药基础理论五元学说、三因学说、阴阳（寒热）学说、胚胎学、七精华三秽学、体质学、脏腑学、病因学、病机学、诊断学、疾病分类学、治疗学、生理学、心理学、脏腑学说、脉络学说、诊断学、脉诊学、尿诊学、养生学、藏医伦理学、藏医心理学、藏医护理学等21个科目的内涵，重点述评贯穿于藏医药学术始终的核心理论五元学说、三因学说、阴阳（寒热）学说对藏医生理、病理、诊断、治疗和药物作用机理等学术思想方面的指导作用，揭示藏医药学的自然属性和“天人合一”及整体观念，以期凸显藏医药理论体系独具一格的特点。